نجحت شركة CHKBiotech في تطوير مجموعة أدوات للكشف عن متغيرات فيروس كورونا الجديدة

سلالة متغيرة لفيروس كورونا الجديد 501Y-V2 في جنوب إفريقيا
في 18 ديسمبر 2020 ، اكتشفت جنوب إفريقيا طفرة 501Y-V2 لفيروس كورونا الجديد. الآن انتشر متحولة جنوب إفريقيا إلى أكثر من 20 دولة. أظهرت التجارب أن طفرات فيروس كورونا الجديد قد تحمل متغيرات أخرى من فيروس كورونا الجديد من طفرات K417N / T و E484K و N501Y التي يمكن أن تقلل من قدرة تحييد الأجسام المضادة التي يسببها اللقاح ضد البلازما. ومع ذلك ، بالمقارنة مع الجينوم المرجعي Wuh01 (رقم التسلسل MN908947) ، فإن 501Y.V2 من تسلسل الجينوم المتحور في جنوب إفريقيا يحتوي على 23 نوعًا من أنواع النيوكليوتيدات. يحتوي على نفس طفرة N501Y مثل النوع الفرعي B.1.1.7 المتحول في بريطانيا ، لكنه لا يزال يحتوي على طفرات في موقعين رئيسيين E484K و K417N من بروتين S لهما تأثيرات مهمة محتملة على قدرة الفيروس على الإصابة.

فيروس كورونا الجديد هو فيروس RNA أحادي الشريطة ، وتكثر طفرات الجينوم فيه. يمكن أن يؤدي اكتشاف الهدف الفردي بسهولة إلى عدم الكشف عن العينات ذات الحمل الفيروسي المنخفض وسلالات الفيروس المتحولة. يمكن أن يصل معدل إعادة الفحص في الحالة الفردية الإيجابية في الكشف عن الهدف إلى أكثر من 10٪ ، مما قد يزيد من عبء العمل ويطيل وقت التشخيص. الكشف عن الأهداف المتعددة والتحقق المتبادل من نتائج كل هدف يمكن أن يزيد من معدل الكشف ويسهل التشخيص المبكر.

news1

الشكل 1. رسم تخطيطي لآلية عدوى فيروس كورونا الجديد

متحولة فيروس كورونا الجديد B.1.1.7 من بريطانيا
في 26 ديسمبر 2020 ، نُشرت الورقة العلمية الأولى لسلالة B.1.1.7 على الإنترنت. أكد معهد الصحة بجامعة لندن بالمملكة المتحدة والأمراض الاستوائية أن سلالة B.1.1.7 أكثر قدرة على الانتشار من السلالات الأخرى ، والتي كانت أكثر من 56٪ (95٪ CI 50-74٪). نظرًا لأن هذه السلالة المتحولة الجديدة تتمتع بقوة نقل أكثر وضوحًا ، فقد أصبح من الصعب السيطرة على COVID-19. في اليوم التالي ، قامت جامعة برمنغهام في المملكة المتحدة بتحميل مقال على MedRxiv. وجدت الدراسة أن عدد النسخ الجينية لفيروسات ORF1ab و N في المرضى المصابين بالسلالة الطافرة B.1.1.7 (تسرب الجين S) قد زاد بشكل ملحوظ. تم رصد هذه الظاهرة في السكان. تشير هذه المقالة إلى أن المرضى المصابين بالطفرة B.1.1.7 في بريطانيا لديهم حمولة فيروسية أعلى بكثير ، لذلك قد يكون هذا الطاف أكثر مسبباتًا للأمراض.

1

الشكل 2. تسلسل طفرة الجينوم الموجود في سلالة الفيروس التاجي الطافرة B.1.1.7 من بريطانيا

2

الشكل 3. حدثت طفرة N501Y في كل من بريطانيا وجنوب إفريقيا المتغيرات

مجموعة أدوات الكشف عن متغيرات فيروس كورونا الجديدة
نجحت شركة Chuangkun Biotech Inc. في تطوير مجموعة اكتشاف لمتغيرات فيروس كورونا الجديدة B.1.1.7 و 501Y-V2.

مزايا هذا المنتج: حساسية عالية , الكشف المتزامن لـ 4 أهداف ، تغطي مواقع الطفرات الرئيسية لسلالة متحولة B.1.1.7 وسلالة متحولة 501Y.V2 جنوب إفريقيا. يمكن لهذه المجموعة الكشف في وقت واحد عن مواقع الطفرات N501Y و HV69-70del و E484K وجين فيروس كورونا الجديد ؛ اختبار سريع: يستغرق الأمر ساعة و 30 دقيقة فقط من جمع العينة حتى النتيجة.

3

الشكل 4. الكشف عن منحنى التضخيم المتغير لـ COVID-19 في بريطانيا

4

الشكل 5. الكشف عن منحنى التضخيم المتغير لـ COVID-19 في جنوب إفريقيا

5

الشكل 6. النوع البري لمنحنى تضخيم فيروس كورونا الجديد

ليس من الواضح كيف تتراكم هذه الطفرات تأثيرًا جديدًا طويل المدى لوباء COVID-19. لكن هذا يذكرنا بأن هذه الطفرات قد تؤثر على فعالية المناعة الطبيعية والمناعة الناتجة عن التطعيم. يذكرنا أيضًا أننا بحاجة إلى مراقبة فيروس كورونا الجديد باستمرار لفترة طويلة وتحديث لقاح COVID-19 للتعامل مع تطور فيروس كورونا الجديد.


الوقت ما بعد: مارس -12-2021