中文السلالة الجديدة لفيروس كورونا 501Y-V2 في جنوب أفريقيا
في 18 ديسمبر 2020، اكتشفت جنوب أفريقيا طفرة 501Y-V2 لفيروس كورونا الجديد.والآن انتشر الطافرة الجنوب أفريقية إلى أكثر من 20 دولة.أظهرت التجارب أن طفرات فيروس كورونا الجديد قد تحمل متغيرات أخرى من فيروس كورونا الجديد من طفرات K417N/T وE484K وN501Y التي يمكن أن تقلل من قدرة تحييد الأجسام المضادة المعادلة للبلازما الناجمة عن اللقاح.ومع ذلك، بالمقارنة مع الجينوم المرجعي Wuh01 (رقم التسلسل MN908947)، فإن 501Y.V2 لتسلسل الجينوم الطافر في جنوب إفريقيا يحتوي على 23 نوعًا مختلفًا من النيوكليوتيدات.إنه يحتوي على نفس طفرة N501Y مثل النوع الفرعي B.1.1.7 المتحور في بريطانيا، لكنه لا يزال يحتوي على طفرات في موقعين رئيسيين E484K وK417N من بروتين S والتي لها تأثيرات مهمة محتملة على قدرة الفيروس على العدوى.
فيروس كورونا الجديد هو فيروس ذو حمض نووي ريبوزي مفرد الشريط، والذي تكون طفرات الجينوم فيه أكثر تواتراً.يمكن أن يؤدي الكشف عن هدف واحد بسهولة إلى عدم الكشف عن العينات ذات الحمل الفيروسي المنخفض وسلالات الفيروس المتحولة.يمكن أن يصل معدل إعادة الفحص في الحالة الإيجابية الواحدة في الكشف عن الهدف إلى أكثر من 10%، مما قد يزيد من عبء العمل ويطيل وقت التشخيص.يمكن أن يؤدي اكتشاف الأهداف المتعددة والتحقق المتبادل من نتائج كل هدف إلى زيادة معدل الكشف وتسهيل التشخيص المبكر.
الشكل 1. رسم تخطيطي لآلية الإصابة بفيروس كورونا الجديد
فيروس كورونا الجديد المتحور B.1.1.7 من بريطانيا
في 26 ديسمبر 2020، تم نشر أول ورقة علمية عن سلالة B.1.1.7 على الإنترنت.أكد معهد الصحة بجامعة لندن بالمملكة المتحدة وأمراض المناطق الاستوائية، أن السلالة B.1.1.7 أكثر قدرة على الانتشار من السلالات الأخرى، بنسبة تزيد عن 56% (95% CI 50-74%).ونظرًا لأن هذه السلالة المتحورة الجديدة تتمتع بقدرة نقل أكثر وضوحًا، فقد أصبح من الصعب السيطرة على كوفيد-19.وفي اليوم التالي، قامت جامعة برمنغهام في المملكة المتحدة بتحميل مقال على MedRxiv.وجدت الدراسة أن عدد النسخ الجينية لفيروس ORF1ab وN في المرضى المصابين بالسلالة الطافرة B.1.1.7 (تسرب الجين S) قد زاد بشكل ملحوظ؛وتم رصد هذه الظاهرة بين السكان.تشير هذه المقالة إلى أن المرضى المصابين بالطفرة B.1.1.7 البريطانية لديهم حمل فيروسي أعلى بكثير، لذلك قد يكون هذا الطفرة أكثر إمراضًا أيضًا.
الشكل 2. تسلسل طفرة الجينوم الموجود في سلالة فيروس كورونا المتحولة B.1.1.7 في بريطانيا
الشكل 3. حدثت طفرة N501Y في كل من بريطانيا وجنوب أفريقياالمتغيرات
مجموعة الكشف عن متغيرات فيروس كورونا الجديد
نجحت شركة Chuangkun Biotech Inc. في تطوير مجموعة أدوات الكشف عن المتغيرات الجديدة لفيروس كورونا B.1.1.7 و501Y-V2.
مزايا هذا المنتج: حساسية عالية، كشف متزامن لأربعة أهداف، يغطي مواقع الطفرة الرئيسية للسلالة الطافرة B.1.1.7 وسلالة الطافرة 501Y.V2 في جنوب أفريقيا.يمكن لهذه المجموعة اكتشاف مواقع الطفرات N501Y وHV69-70del وE484K وجين فيروس كورونا الجديد في وقت واحد؛اختبار سريع: يستغرق الأمر ساعة و30 دقيقة فقط من جمع العينات حتى تظهر النتيجة.
الشكل 4. الكشف عن منحنى التضخيم المتغير لكوفيد-19 في بريطانيا
الشكل 5. الكشف عن منحنى تضخيم متغير فيروس كورونا في جنوب أفريقيا
الشكل 6. النوع البري لمنحنى تضخيم فيروس كورونا الجديد
ليس من الواضح كيف تتراكم هذه الطفرات تأثيرًا جديدًا طويل المدى لجائحة كوفيد-19.لكن هذا يذكرنا بأن هذه الطفرات قد تؤثر على فعالية المناعة الطبيعية والمناعة الناتجة عن التطعيم.ويذكرنا أيضًا أننا بحاجة إلى مراقبة فيروس كورونا الجديد بشكل مستمر لفترة طويلة وتحديث لقاح كوفيد-19 للتعامل مع تطور فيروس كورونا الجديد.
وقت النشر: 12 مارس 2021